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ATP荧光检测仪实现了对食品微生物含量的检测，可用于检测食品中的微生物。仪器基于萤火虫发光的原理，可以快速检测ATP。因为所有的活细胞都含有恒定量的ATP，所以检测ATP含量可以清楚地表明样品中微生物的数量，判断样品的卫生状况。
在食品出厂前检测食品中的微生物很重要，食品中的微生物根据是否对人体有害可分为两类：一类是有益菌，可用于食品加工生产。另一类是有害细菌，会引起食物中毒或传染病。因此，食品中的细菌总数和大肠菌群都进行了标准定义。由于所有活细胞都含有衡量ATP，ATP含量可以清楚地反映出测试样品中的微生物含量，从而判断其卫生状况。
食品中含有的微生物是导致食品变质的主要因素，人们日常生活中各种食物的存放方式也是为了防止微生物在食物中滋生，加速食物变质，然而，微生物无处不在。ATP荧光检测仪用于检测食品中的微生物，对食品进行微生物检测，有利于保证产品的安全性，防止变质的食品在市场上销售。
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