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ATP荧光检测仪可以检测食品中的微生物含量，食品的微生物检测是食品安全管理的重要组成部分。食品的微生物检测是判断食品卫生安全的重要指标之一，也可以判断被检测食品是否健康可食用。用ATP荧光检测仪检测食品中的微生物含量，根据检测结果，判断食品的清洁度和食品加工环境的卫生程度，推断食品被细菌污染的程度，为各项卫生管理工作提供数据支持。
ATP荧光检测仪检测的主要微生物指标有菌落总数、大肠菌群和致病菌等，这些微生物一旦进入人体，就会对人体造成一定程度的危害，因此，食品出厂前应进行检测，以确保所售食品的卫生安全。仪器不仅可以检测加工食品表面的洁净度，还可以检测食品的加工环境、加工中使用的原料、食品加工者的卫生条件、食品包装材料、食品加工工具等，在食品安全和卫生检测中发挥着重要作用。
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