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ATP荧光检测仪可以检测食品原料、加工食品、食品用具、包装材料等的安全性，并判断卫生情况。大肠菌群是判断食品微生物污染的主要指标之一，大肠菌群超标的原因包括食品加工原料、包装材料和食品生产中使用器具的微生物污染。菌落总数通常用来评价食品的洁净度，所以ATP荧光检测仪可以检测食品中的菌落总数和大肠菌群，从而判断食品的微生物污染情况。同时，ATP荧光检测仪不仅可以检测食品，还可以检测食品加工原料、食品包装材料、加工设备和环境卫生，避免食品被污染的可能。
一般来说，微生物不仅可以在食品加工中发挥有益的作用，也可以通过食品对人的健康构成威胁。食品的微生物检测是食品检测中*一部分，是衡量食品卫生质量的重要指标之一，也是判断被检食品是否安全可食用的科学依据之一。同时，微生物检测可以判断食品加工环境和食品卫生环境，正确评价食品被细菌污染的程度，为卫生管理提供科学依据。
ATP荧光检测仪适用于快速检测餐具和食品加工用具的表面清洁度，ATP是生物能转化的产物，存在于所有活的细胞体中，当ATP与荧光素酶接触时，会发生反应产生光，物体表面残留的食物和微生物越多，ATP就越多，荧光就越强。使用ATP荧光检测仪可以记录这种光的强度，以判断受检样品的卫生状况。
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